Reactome | RPS4Y2 [cytosol]

RPS4Y2 [cytosol]

Stable Identifier

R-HSA-8868834

Type

Protein [EntityWithAccessionedSequence]

Species

Homo sapiens

Compartment

cytosol

Synonyms

40S ribosomal protein S4, Y isoform 2, RS4Y2_HUMAN

Locations in the PathwayBrowser

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Cellular responses to stimuli (Homo sapiens)

- Cellular responses to stress (Homo sapiens)
  - Cellular response to starvation (Homo sapiens)
    - Response of EIF2AK4 (GCN2) to amino acid deficiency (Homo sapiens)
      - EIF2AK4 (GCN2) binds tRNA (Homo sapiens)
        
        EIF2AK4:GCN1:80S ribosome:mRNA [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S Ribosome:mRNA Complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        tRNA:EIF2AK4:GCN1:80S Ribosome:mRNA [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S Ribosome:mRNA Complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
      - EIF2AK4 (GCN2) dimer autophosphorylates (Homo sapiens)
        
        tRNA:EIF2AK4:GCN1:80S Ribosome:mRNA [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S Ribosome:mRNA Complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        tRNA:p-T899-EIF2AK4:GCN1:80S Ribosome:mRNA [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S Ribosome:mRNA Complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
      - IMPACT binds GCN1 (Homo sapiens)
        
        GCN1:80S ribosome:mRNA [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S Ribosome:mRNA Complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        IMPACT:GCN1:80S ribosome:mRNA [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S Ribosome:mRNA Complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
      - p-T899-EIF2AK4 (GCN2) phosphorylates EIF2AS1 (Homo sapiens)
        
        tRNA:p-T899-EIF2AK4:GCN1:80S Ribosome:mRNA [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S Ribosome:mRNA Complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)

Developmental Biology (Homo sapiens)

- Nervous system development (Homo sapiens)
  - Axon guidance (Homo sapiens)
    - Signaling by ROBO receptors (Homo sapiens)
      - Regulation of expression of SLITs and ROBOs (Homo sapiens)
        
        Translation of ROBO3.2 mRNA initiates NMD (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        Translated ROBO3.2 mRNA in complex with NMD-initiating UPF2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        Translation of ROBO3.2 mRNA is negatively regulated by NMD (Homo sapiens)
        
        Translated ROBO3.2 mRNA in complex with NMD-initiating UPF2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)

Disease (Homo sapiens)

- Infectious disease (Homo sapiens)
  - Viral Infection Pathways (Homo sapiens)
    - Influenza Infection (Homo sapiens)
      - Influenza Viral RNA Transcription and Replication (Homo sapiens)
        
        Viral mRNA Translation (Homo sapiens)
        
        Synthesis of PB1-F2 (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        Viral Protein Synthesis (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
    - SARS-CoV Infections (Homo sapiens)
      - SARS-CoV-1 Infection (Homo sapiens)
        
        SARS-CoV-1-host interactions (Homo sapiens)
        
        SARS-CoV-1 modulates host translation machinery (Homo sapiens)
        
        SARS-CoV-1 nsp1 binds to 40S ribosomal subunit (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex:nsp1 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
      - SARS-CoV-2 Infection (Homo sapiens)
        
        SARS-CoV-2-host interactions (Homo sapiens)
        
        SARS-CoV-2 modulates host translation machinery (Homo sapiens)
        
        SARS-CoV-2 nsp1 binds to 40S ribosomal complex (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex:nsp1 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)

Metabolism (Homo sapiens)

- Metabolism of amino acids and derivatives (Homo sapiens)
  - Selenoamino acid metabolism (Homo sapiens)
    - Selenocysteine synthesis (Homo sapiens)
      - 80S:Met-tRNAi:mRNA:SECISBP2:Sec-tRNA(Sec):EEFSEC:GTP is hydrolysed to 80S:Met-tRNAi:mRNA:SECISBP2:Sec and EEFSEC:GDP by EEFSEC (Homo sapiens)
        
        80S:Met-tRNAi:mRNA:SECISBP2:Sec [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S:Met-tRNAi:mRNA [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S:Met-tRNAi:mRNA:SECISBP2:Sec-tRNA(Sec):EEFSEC:GTP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S:Met-tRNAi:mRNA [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
      - Sec-tRNA(Sec):EEFSEC:GTP binds to 80S Ribosome (Homo sapiens)
        
        80S:Met-tRNAi:mRNA [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S:Met-tRNAi:mRNA:SECISBP2:Sec-tRNA(Sec):EEFSEC:GTP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S:Met-tRNAi:mRNA [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)

Metabolism of RNA (Homo sapiens)

- Nonsense-Mediated Decay (NMD) (Homo sapiens)
  - Nonsense Mediated Decay (NMD) enhanced by the Exon Junction Complex (EJC) (Homo sapiens)
    - SMG1 phosphorylates UPF1 (enhanced by Exon Junction Complex) (Homo sapiens)
      - SMG1:Phosphorylated UPF1:EJC:Translated mRNP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        Translated mRNA Complex with Premature Termination Codon Preceding Exon Junction [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
      - SMG1:UPF1:EJC:Translated mRNP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        Translated mRNA Complex with Premature Termination Codon Preceding Exon Junction [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
    - SMG6 hydrolyzes mRNA with premature termination codon (Homo sapiens)
      - Phosphorylated UPF1:SMG5:SMG7:SMG6:PP2A:Translated mRNP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        Translated mRNA Complex with Premature Termination Codon Preceding Exon Junction [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
    - UPF1 binds an mRNP with a termination codon preceding an Exon Junction Complex (Homo sapiens)
      - SMG1:UPF1:EJC:Translated mRNP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        Translated mRNA Complex with Premature Termination Codon Preceding Exon Junction [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
      - Translated mRNA Complex with Premature Termination Codon Preceding Exon Junction [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
    - p-4S-UPF1 recruits SMG5, SMG7, SMG6, PNRC2, DCP1A, and PP2A (Homo sapiens)
      - Phosphorylated UPF1:SMG5:SMG7:SMG6:PP2A:Translated mRNP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        Translated mRNA Complex with Premature Termination Codon Preceding Exon Junction [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
      - SMG1:Phosphorylated UPF1:EJC:Translated mRNP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        Translated mRNA Complex with Premature Termination Codon Preceding Exon Junction [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
  - Nonsense Mediated Decay (NMD) independent of the Exon Junction Complex (EJC) (Homo sapiens)
    - Formation of UPF1:eRF3 complex on mRNA with a premature termination codon and no Exon Junction Complex (Homo sapiens)
      - Translated mRNA Complex with Premature Termination Codon Not Preceding Exon Junction [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
      - UPF1:eRF3 Complex on Translated mRNA [cytosol] (Homo sapiens)
        
        Translated mRNA Complex with Premature Termination Codon Not Preceding Exon Junction [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
- rRNA processing (Homo sapiens)
  - rRNA processing in the nucleus and cytosol (Homo sapiens)
    - Major pathway of rRNA processing in the nucleolus and cytosol (Homo sapiens)
      - 18SE pre-rRNA in pre-40S particles is nucleolytically processed during translocation from the nucleus to the cytosol (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)

Metabolism of proteins (Homo sapiens)

- Translation (Homo sapiens)
  - Eukaryotic Translation Elongation (Homo sapiens)
    - Peptide chain elongation (Homo sapiens)
      - Aminoacyl-tRNA binds to the ribosome at the A-site (Homo sapiens)
        
        80S:Met-tRNAi:mRNA [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S:aminoacyl tRNA:mRNA:eEF1A:GTP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S:Met-tRNAi:mRNA [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
      - Hydrolysis of eEF1A:GTP (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S:Met-tRNAi:mRNA:aminoacyl-tRNA [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S:Met-tRNAi:mRNA [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S:aminoacyl tRNA:mRNA:eEF1A:GTP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S:Met-tRNAi:mRNA [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
      - Peptide transfer from P-site tRNA to the A-site tRNA (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S:Met-tRNAi:mRNA:aminoacyl-tRNA [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S:Met-tRNAi:mRNA [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        Elongation complex with growing peptide chain [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
      - Translocation of ribosome by 3 bases in the 3' direction (Homo sapiens)
        
        80S Ribosome:mRNA:peptidyl-tRNA with elongating peptide [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        Elongation complex with growing peptide chain [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
  - Eukaryotic Translation Initiation (Homo sapiens)
    - Cap-dependent Translation Initiation (Homo sapiens)
      - Activation of the mRNA upon binding of the cap-binding complex and eIFs, and subsequent binding to 43S (Homo sapiens)
        
        Translation initiation complex formation (Homo sapiens)
        
        Formation of translation initiation complexes containing mRNA that does not circularize (Homo sapiens)
        
        43S complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        43S:mRNA:eIF4F:eIF4B:eIF4H [cytosol] (Homo sapiens)
        
        43S complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        Formation of translation initiation complexes yielding circularized Ceruloplasmin mRNA in a 'closed-loop' conformation (Homo sapiens)
        
        43S complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        43S: Ceruloplasmin mRNA:eIF4F:eIF4B:eIF4H:PABP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        43S complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
      - Formation of a pool of free 40S subunits (Homo sapiens)
        
        Release of 40S and 60S subunits from the 80S ribosome (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        eIF3 and eIF1A bind to the 40S subunit (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S:eIF3:eIF1A [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
      - Formation of the ternary complex, and subsequently, the 43S complex (Homo sapiens)
        
        Formation of the 43S pre-initiation complex (Homo sapiens)
        
        40S:eIF3:eIF1A [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        43S complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
      - GTP hydrolysis and joining of the 60S ribosomal subunit (Homo sapiens)
        
        The 60S subunit joins the translation initiation complex (Homo sapiens)
        
        40S:Met-tRNAi:mRNA [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S:Met-tRNAi:mRNA:eIF5B:GTP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        eIF2:GTP is hydrolyzed, eIFs are released (Homo sapiens)
        
        40S:Met-tRNAi:mRNA [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        48S complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        43S complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        eIF5B:GTP is hydrolyzed and released (Homo sapiens)
        
        80S:Met-tRNAi:mRNA [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S:Met-tRNAi:mRNA:eIF5B:GTP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
      - Ribosomal scanning and start codon recognition (Homo sapiens)
        
        Ribosomal scanning (Homo sapiens)
        
        43S:mRNA:eIF4F:eIF4B:eIF4H [cytosol] (Homo sapiens)
        
        43S complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        48S complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        43S complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        Start codon recognition (Homo sapiens)
        
        48S complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        43S complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
    - L13a-mediated translational silencing of Ceruloplasmin expression (Homo sapiens)
      - Association of phospho-L13a with GAIT element of Ceruloplasmin mRNA (Homo sapiens)
        
        43S: Ceruloplasmin mRNA:eIF4F:eIF4B:eIF4H:PABP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        43S complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        phospho-L13a associated wth the 3' UTR GAIT element of ceruloplasmin mRNA within the translation initiation complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        43S: Ceruloplasmin mRNA:eIF4F:eIF4B:eIF4H:PABP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        43S complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
  - Eukaryotic Translation Termination (Homo sapiens)
    - GTP Hydrolysis by eRF3 bound to the eRF1:mRNA:polypeptide:80S Ribosome complex (Homo sapiens)
      - Me-Q185-ETF1 dimer:eRF3:GDP:80S Ribosome:mRNA:peptidyl-tRNA Complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S Ribosome:mRNA:peptidyl-tRNA with elongating peptide [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
      - Me-Q185-ETF1 dimer:eRF3:GTP:80S Ribosome:mRNA:peptidyl-tRNA [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S Ribosome:mRNA:peptidyl-tRNA with elongating peptide [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
    - GTP bound eRF3:eRF1 complex binds the peptidyl tRNA:mRNA:80S Ribosome complex (Homo sapiens)
      - 80S Ribosome:mRNA:peptidyl-tRNA with elongating peptide [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
      - Me-Q185-ETF1 dimer:eRF3:GTP:80S Ribosome:mRNA:peptidyl-tRNA [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S Ribosome:mRNA:peptidyl-tRNA with elongating peptide [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
    - Polypeptide release from the eRF3-GDP:eRF1:mRNA:80S Ribosome complex (Homo sapiens)
      - Me-Q185-ETF1 dimer:eRF3:GDP:80S Ribosome:mRNA:peptidyl-tRNA Complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S Ribosome:mRNA:peptidyl-tRNA with elongating peptide [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
      - Me-Q185-ETF1 dimer:eRF3:GDP:80S Ribosome:mRNA:tRNA Complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
  - SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane (Homo sapiens)
    - Nascent polypeptide:mRNA:ribosome complex binds signal recognition particle (SRP) (Homo sapiens)
      - SRP:polypeptide+signal:ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        ribosome:mRNA:polypeptide+signal [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
      - ribosome:mRNA:polypeptide+signal [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
    - Signal peptidase hydrolyzes signal peptide from ribosome-associated nascent protein (Homo sapiens)
      - cleaved polypeptide:Translocon [endoplasmic reticulum membrane] (Homo sapiens)
        
        membrane-bound ribosome:mRNA:cleaved polypeptide [endoplasmic reticulum membrane] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
      - polypeptide+signal:Translocon [endoplasmic reticulum membrane] (Homo sapiens)
        
        membrane-bound ribosome:mRNA:polypeptide+signal [endoplasmic reticulum membrane] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
    - Signal-containing nascent peptide translocates to endoplasmic reticulum (Homo sapiens)
      - SRP receptor:SRP:ribosome:polypeptide+signal [endoplasmic reticulum membrane] (Homo sapiens)
        
        SRP:polypeptide+signal:ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        ribosome:mRNA:polypeptide+signal [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
      - polypeptide+signal:Translocon [endoplasmic reticulum membrane] (Homo sapiens)
        
        membrane-bound ribosome:mRNA:polypeptide+signal [endoplasmic reticulum membrane] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
    - Synthesis of nascent polypeptide containing signal sequence (Homo sapiens)
      - 80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
      - ribosome:mRNA:polypeptide+signal [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
    - The SRP receptor binds the SRP:nascent peptide:ribosome complex (Homo sapiens)
      - SRP receptor:SRP:ribosome:polypeptide+signal [endoplasmic reticulum membrane] (Homo sapiens)
        
        SRP:polypeptide+signal:ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        ribosome:mRNA:polypeptide+signal [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
      - SRP:polypeptide+signal:ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        ribosome:mRNA:polypeptide+signal [cytosol] (Homo sapiens)
        
        80S ribosome [cytosol] (Homo sapiens)
        
        40S ribosomal complex [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)

External Reference Information

External Reference

UniProt:Q8TD47 RPS4Y2

Gene Names

RPS4Y2, RPS4Y2P

Chain

chain:1-263

Reference Genes

BioGPS Gene:140032 RPS4Y2

COSMIC (genes):RPS4Y2 RPS4Y2

CTD Gene:140032 RPS4Y2

dbSNP Gene:140032 RPS4Y2

ENSEMBL:ENSG00000280969 RPS4Y2

HGNC:18501 RPS4Y2

KEGG:hsa:140032 RPS4Y2

Monarch:140032 RPS4Y2

NCBI Gene:140032 RPS4Y2

OMIM:400030 RPS4Y2

UCSC:Q8TD47 RPS4Y2

Reference Transcript

RefSeq:NM_001039567.2 RPS4Y2

Other Identifiers

11738931_at

11738932_x_at

140032

17116420

4031169

4031175

4031176

4031177

4031178

4031179

4031180

4031181

8176730

A_23_P324384

GE570933

GO:0003674

GO:0003723

GO:0003735

GO:0005198

GO:0005575

GO:0005840

GO:0006412

GO:0008150

GO:0019843

GO:0022627

GO:0043226

GO:1990904

HMNXSV003046928

ILMN_2191331

PH_hs_0029887

PH_hs_0032876

TC0Y000073.hg

Participates

as a candidate of

RPS4X,RPS4Y1,RPS4Y2 [cytosol] (Homo sapiens)

Other forms of this molecule

RPS4Y2 [nucleoplasm]

Inferred To

rps-4 [cytosol] (Caenorhabditis elegans)

Homologues of RPS4Y2 [cytosol] (Bos taurus)

Homologues of RPS4Y2 [cytosol] (Canis familiaris)

Homologues of RPS4Y2 [cytosol] (Rattus norvegicus)

Homologues of RPS4Y2 [cytosol] (Saccharomyces cerevisiae)

Homologues of RPS4Y2 [cytosol] (Schizosaccharomyces pombe)

rps402 [cytosol] (Schizosaccharomyces pombe)

RPS4X [cytosol] (Canis familiaris)

RPS4X [cytosol] (Sus scrofa)

rps403 [cytosol] (Schizosaccharomyces pombe)

rps401 [cytosol] (Schizosaccharomyces pombe)

LOC102154781 [cytosol] (Canis familiaris)

RPS4 [cytosol] (Bos taurus)

RPS4 [cytosol] (Gallus gallus)

RpS4 [cytosol] (Drosophila melanogaster)

Rps4x [cytosol] (Mus musculus)

Rps4x [cytosol] (Rattus norvegicus)

RPS4Y1 [cytosol] (Bos taurus)

Rps4y2 [cytosol] (Rattus norvegicus)

RPS4B [cytosol] (Saccharomyces cerevisiae)

RPS4Y2 [cytosol] (Bos taurus)

RPS4Y2 [cytosol] (Canis familiaris)

RPS4Y2 [cytosol] (Plasmodium falciparum)

rps4 [cytosol] (Dictyostelium discoideum)

rps4 [cytosol] (Xenopus tropicalis)

rps4x [cytosol] (Danio rerio)

RPS4A [cytosol] (Saccharomyces cerevisiae)

Cross References

RefSeq

NP_001034656.1

ENSEMBL

ENSP00000486252, ENST00000629237

OpenTargets

ENSG00000280969

HPA

ENSG00000280969-RPS4Y2

PRO

Q8TD47

Pharos - Targets

Q8TD47

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