Reactome | PRKAB1 [cytosol]

PRKAB1 [cytosol]

Stable Identifier

R-HSA-380968

Type

Protein [EntityWithAccessionedSequence]

Species

Homo sapiens

Compartment

cytosol

Synonyms

AMPK beta1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, AAKB1_HUMAN

Locations in the PathwayBrowser

Expand all

Autophagy (Homo sapiens)

- Macroautophagy (Homo sapiens)
  - AMPK (complex) phosphorylates ULK1 (complex) (Homo sapiens)
    - p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
      - p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)
    - p-AMPK heterotrimer:AMP:ULK1:ATG13:RB1CC1:ATG101 [cytosol] (Homo sapiens)
      - p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)
    - p-AMPK heterotrimer:AMP:p-S317,467,556,638,T575-ULK1:ATG13:RB1CC1:ATG101 [cytosol] (Homo sapiens)
      - p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)
  - Selective autophagy (Homo sapiens)
    - Lipophagy (Homo sapiens)
      - PRKAA2 phosphorylates PLINs (Homo sapiens)
        
        AMPK-alpha2:AMPK-beta:AMPK-gamma:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)
  - Thr-180 of ULK1 is phosphorylated (Homo sapiens)
    - p-AMPK heterotrimer:AMP:p-S317,467,556,638,T575-ULK1:ATG13:RB1CC1:ATG101 [cytosol] (Homo sapiens)
      - p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)
    - p-AMPK heterotrimer:AMP:p-T180,S317,467,556,638,T575-ULK1:ATG13:RB1CC1:ATG101 [cytosol] (Homo sapiens)
      - p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)
  - ULK complex translocates to the ER (Homo sapiens)
    - p-AMPK heterotrimer:AMP:p-T180,S317,467,556,638,T575-ULK1:ATG13:RB1CC1:ATG101 [endoplasmic reticulum membrane] (Homo sapiens)
      - p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)
    - p-AMPK heterotrimer:AMP:p-T180,S317,467,556,638,T575-ULK1:p-ATG13:p-RB1CC1:ATG101 [cytosol] (Homo sapiens)
      - p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)
  - ULK1 phosphorylates AMBRA1:BECN1 complex (Homo sapiens)
    - p-AMPK heterotrimer:AMP:p-T180,S317,467,556,638,T575-ULK1:ATG13:RB1CC1:ATG101 [endoplasmic reticulum membrane] (Homo sapiens)
      - p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)
  - ULK1 phosphorylates ATG13 and RB1CC1 (Homo sapiens)
    - p-AMPK heterotrimer:AMP:p-T180,S317,467,556,638,T575-ULK1:ATG13:RB1CC1:ATG101 [cytosol] (Homo sapiens)
      - p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)
    - p-AMPK heterotrimer:AMP:p-T180,S317,467,556,638,T575-ULK1:p-ATG13:p-RB1CC1:ATG101 [cytosol] (Homo sapiens)
      - p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)
  - ULK1 phosphorylates Beclin-1 (Homo sapiens)
    - p-AMPK heterotrimer:AMP:p-T180,S317,467,556,638,T575-ULK1:ATG13:RB1CC1:ATG101 [endoplasmic reticulum membrane] (Homo sapiens)
      - p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)
  - p-AMPK:AMP binds the ULK complex (Homo sapiens)
    - p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
      - p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)
    - p-AMPK heterotrimer:AMP:ULK1:ATG13:RB1CC1:ATG101 [cytosol] (Homo sapiens)
      - p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)
  - p-AMPK:AMP phosphorylates Raptor in the MTORC1 complex (Homo sapiens)
    - p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
      - p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)

Gene expression (Transcription) (Homo sapiens)

- RNA Polymerase II Transcription (Homo sapiens)
  - Generic Transcription Pathway (Homo sapiens)
    - Transcriptional Regulation by TP53 (Homo sapiens)
      - TP53 Regulates Metabolic Genes (Homo sapiens)
        
        SESN1,2,3 bind AMPK (Homo sapiens)
        
        SESN1,2,3:p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK phosphorylates TSC1:TSC2 (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)

Vesicle-mediated transport (Homo sapiens)

- Membrane Trafficking (Homo sapiens)
  - Translocation of SLC2A4 (GLUT4) to the plasma membrane (Homo sapiens)
    - AMPK-alpha2 phosphorylates TBC1D1 (Homo sapiens)
      - AMPK-alpha2:AMPK-beta:AMPK-gamma:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)

External Reference Information

External Reference

UniProt:Q9Y478 PRKAB1

Gene Names

PRKAB1, AMPK

Chain

initiator methionine:1, chain:2-270

Reference Genes

BioGPS Gene:5564 PRKAB1

COSMIC (genes):PRKAB1 PRKAB1

CTD Gene:5564 PRKAB1

dbSNP Gene:5564 PRKAB1

ENSEMBL:ENSG00000111725 PRKAB1

HGNC:9378 PRKAB1

KEGG:hsa:5564 PRKAB1

Monarch:5564 PRKAB1

NCBI Gene:5564 PRKAB1

OMIM:602740 PRKAB1

UCSC:Q9Y478 PRKAB1

Reference Transcript

Other Identifiers

11716217_a_at

11716218_s_at

11751635_a_at

16757806

201834_PM_at

201834_at

201835_PM_s_at

201835_s_at

3434144

3434145

3434146

3434147

3434148

3434149

3434150

3434151

3434152

3434153

3434155

3434156

3434157

3434158

3434159

35348_at

5564

7959123

A_14_P116465

A_23_P204503

GE54167

GO:0005515

GO:0005634

GO:0005654

GO:0005737

GO:0005829

GO:0006629

GO:0006631

GO:0006633

GO:0007165

GO:0019901

GO:0031588

GO:0031669

GO:0032991

GO:0035878

GO:0048856

GO:0120162

HMNXSV003025719

ILMN_1793522

PH_hs_0028730

TC12000936.hg

Y12556_at

g12654368_3p_at

g5453967_3p_a_at

Participates

as a member of

AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)

Other forms of this molecule

PRKAB1 [nucleoplasm]

PRKAB1 [endoplasmic reticulum lumen]

Inferred To

prkab1 [cytosol] (Xenopus tropicalis)

prkab1a [cytosol] (Danio rerio)

aakb-1 [cytosol] (Caenorhabditis elegans)

alc [cytosol] (Drosophila melanogaster)

amk2 [cytosol] (Schizosaccharomyces pombe)

Prkab1 [cytosol] (Mus musculus)

Prkab1 [cytosol] (Rattus norvegicus)

PRKAB1 [cytosol] (Bos taurus)

PRKAB1 [cytosol] (Canis familiaris)

PRKAB1 [cytosol] (Gallus gallus)

PRKAB1 [cytosol] (Sus scrofa)

prkab [cytosol] (Dictyostelium discoideum)

GAL83 [cytosol] (Saccharomyces cerevisiae)

Cross References

RefSeq

XP_054228496.1, NP_006244.2, XP_005253966.1

Guide to Pharmacology - Targets

1543

OpenTargets

ENSG00000111725

ENSEMBL

ENSG00000111725, ENSP00000441369, ENST00000229328, ENST00000541640, ENSP00000229328

HPA

ENSG00000111725-PRKAB1

GeneCards

PRKAB1

ZINC target

Q9Y478

PRO

Q9Y478

Pharos - Targets

Q9Y478

PDB

4ZHX, 6C9H, 4CFF, 7MYJ, 8BIK, 5EZV, 4CFE, 6C9G, 6C9F, 6B1U, 5ISO, 6C9J

Interactors (10)

Accession	#Entities	Entities	Confidence Score	Evidence (IntAct)
UniProt:P54646 PRKAA2	5	PRKAA2 [cytosol] (R-HSA-200405) p-T172-PRKAA2 [cytosol] (R-HSA-200417) p-T172-PRKAA2 [nucleoplasm] (R-HSA-164171) p-T172-PRKAA2 [endoplasmic reticulum lumen] (R-HSA-9931258) PRKAA2 [nucleoplasm] (R-HSA-163682)	0.845	10
UniProt:Q07820 MCL1	1	MCL1 [cytosol] (R-HSA-5661490)	0.643	3
UniProt:P32239 CCKBR	1	CCKBR [plasma membrane] (R-HSA-388515)	0.643	3
UniProt:O75385 ULK1	7	ULK1 [cytosol] (R-HSA-1632847) ULK1 [mitochondrial outer membrane] (R-HSA-8948145) p-T180,S317,S467,S556,S638,T575-ULK1 [endoplasmic reticulum membrane] (R-HSA-8948047) p-T180,S317,S467,S556,S638,T575-ULK1 [cytosol] (R-HSA-5675858) p-S317,467,556,638,T575-ULK1 [cytosol] (R-HSA-5673747) p-S758-ULK1 [cytosol] (R-HSA-5672131) ULK1 [recycling endosome] (R-HSA-8854761)	0.641	3
UniProt:P16152 CBR1	1	CBR1 [cytosol] (R-HSA-2142784)	0.564	2
UniProt:O70302 Cidea	2	Cidea [cytosol] (R-MMU-9855021) Cidea [cytosol] (R-MMU-8856626)	0.556	4
UniProt:Q6IAA8 LAMTOR1	5	LAMTOR1 [lysosomal membrane] (R-HSA-5653582) LAMTOR1 [ficolin-1-rich granule membrane] (R-HSA-6801003) LAMTOR1 [plasma membrane] (R-HSA-6806270) LAMTOR1 [specific granule membrane] (R-HSA-6799631) LAMTOR1 [azurophil granule membrane] (R-HSA-6799633)	0.527	3
UniProt:Q8IYL2 TRMT44	1	TRMT44 [cytosol] (R-HSA-6788685)	0.527	2
UniProt:P49590 HARS2	1	HARS2 [mitochondrial matrix] (R-HSA-379581)	0.527	2
UniProt:P62993 GRB2	1	GRB2 [cytosol] (R-HSA-8983328)	0.508	2

Cite Us!