Reactome | PRKAB1 [cytosol]

PRKAB1 [cytosol]

Stable Identifier

R-HSA-380968

Type

Protein [EntityWithAccessionedSequence]

Species

Homo sapiens

Compartment

cytosol

Synonyms

AMPK beta1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, AAKB1_HUMAN

Locations in the PathwayBrowser

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Autophagy (Homo sapiens)

- Macroautophagy (Homo sapiens)
  - AMPK (complex) phosphorylates ULK1 (complex) (Homo sapiens)
    - p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
      - p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)
    - p-AMPK heterotrimer:AMP:ULK1:ATG13:RB1CC1:ATG101 [cytosol] (Homo sapiens)
      - p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)
    - p-AMPK heterotrimer:AMP:p-S317,467,556,638,T575-ULK1:ATG13:RB1CC1:ATG101 [cytosol] (Homo sapiens)
      - p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)
  - Selective autophagy (Homo sapiens)
    - Lipophagy (Homo sapiens)
      - PRKAA2 phosphorylates PLINs (Homo sapiens)
        
        AMPK-alpha2:AMPK-beta:AMPK-gamma:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)
  - Thr-180 of ULK1 is phosphorylated (Homo sapiens)
    - p-AMPK heterotrimer:AMP:p-S317,467,556,638,T575-ULK1:ATG13:RB1CC1:ATG101 [cytosol] (Homo sapiens)
      - p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)
    - p-AMPK heterotrimer:AMP:p-T180,S317,467,556,638,T575-ULK1:ATG13:RB1CC1:ATG101 [cytosol] (Homo sapiens)
      - p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)
  - ULK complex translocates to the ER (Homo sapiens)
    - p-AMPK heterotrimer:AMP:p-T180,S317,467,556,638,T575-ULK1:ATG13:RB1CC1:ATG101 [endoplasmic reticulum membrane] (Homo sapiens)
      - p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)
    - p-AMPK heterotrimer:AMP:p-T180,S317,467,556,638,T575-ULK1:p-ATG13:p-RB1CC1:ATG101 [cytosol] (Homo sapiens)
      - p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)
  - ULK1 phosphorylates AMBRA1:BECN1 complex (Homo sapiens)
    - p-AMPK heterotrimer:AMP:p-T180,S317,467,556,638,T575-ULK1:ATG13:RB1CC1:ATG101 [endoplasmic reticulum membrane] (Homo sapiens)
      - p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)
  - ULK1 phosphorylates ATG13 and RB1CC1 (Homo sapiens)
    - p-AMPK heterotrimer:AMP:p-T180,S317,467,556,638,T575-ULK1:ATG13:RB1CC1:ATG101 [cytosol] (Homo sapiens)
      - p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)
    - p-AMPK heterotrimer:AMP:p-T180,S317,467,556,638,T575-ULK1:p-ATG13:p-RB1CC1:ATG101 [cytosol] (Homo sapiens)
      - p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)
  - ULK1 phosphorylates Beclin-1 (Homo sapiens)
    - p-AMPK heterotrimer:AMP:p-T180,S317,467,556,638,T575-ULK1:ATG13:RB1CC1:ATG101 [endoplasmic reticulum membrane] (Homo sapiens)
      - p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)
  - p-AMPK:AMP binds the ULK complex (Homo sapiens)
    - p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
      - p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)
    - p-AMPK heterotrimer:AMP:ULK1:ATG13:RB1CC1:ATG101 [cytosol] (Homo sapiens)
      - p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)
  - p-AMPK:AMP phosphorylates Raptor in the MTORC1 complex (Homo sapiens)
    - p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
      - p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)

Gene expression (Transcription) (Homo sapiens)

- RNA Polymerase II Transcription (Homo sapiens)
  - Generic Transcription Pathway (Homo sapiens)
    - Transcriptional Regulation by TP53 (Homo sapiens)
      - TP53 Regulates Metabolic Genes (Homo sapiens)
        
        SESN1,2,3 bind AMPK (Homo sapiens)
        
        SESN1,2,3:p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK phosphorylates TSC1:TSC2 (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        p-AMPK heterotrimer [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)

Vesicle-mediated transport (Homo sapiens)

- Membrane Trafficking (Homo sapiens)
  - Translocation of SLC2A4 (GLUT4) to the plasma membrane (Homo sapiens)
    - AMPK-alpha2 phosphorylates TBC1D1 (Homo sapiens)
      - AMPK-alpha2:AMPK-beta:AMPK-gamma:AMP [cytosol] (Homo sapiens)
        
        AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)
        
        PRKAB1 [cytosol] (Homo sapiens)

External Reference Information

External Reference

UniProt:Q9Y478 PRKAB1

Gene Names

PRKAB1, AMPK

Chain

initiator methionine:1, chain:2-270

Reference Genes

BioGPS Gene:5564 PRKAB1

COSMIC (genes):PRKAB1 PRKAB1

CTD Gene:5564 PRKAB1

dbSNP Gene:5564 PRKAB1

ENSEMBL:ENSG00000111725 PRKAB1

ENSEMBL:ENSG00000111725.11 PRKAB1

HGNC:9378 PRKAB1

KEGG Gene (Homo sapiens):5564 PRKAB1

Monarch:5564 PRKAB1

NCBI Gene:5564 PRKAB1

OMIM:602740 PRKAB1

UCSC:Q9Y478 PRKAB1

Reference Transcript

Other Identifiers

11716217_a_at

11716218_s_at

11751635_a_at

16757806

201834_PM_at

201834_at

201835_PM_s_at

201835_s_at

3434144

3434145

3434146

3434147

3434148

3434151

3434152

3434153

3434155

3434157

3434158

3434159

35348_at

5564

7959123

A_14_P116465

A_23_P204503

GE54167

GO:0003824

GO:0004672

GO:0004679

GO:0005515

GO:0005634

GO:0005654

GO:0005737

GO:0005829

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GO:0010628

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GO:0016310

GO:0016740

GO:0019901

GO:0023052

GO:0031588

GO:0031669

GO:0032991

GO:0035878

GO:0036211

GO:0043226

GO:0048856

GO:0120162

GO:0140096

HMNXSV003025719

ILMN_1793522

PH_hs_0028730

TC12000936.hg

Y12556_at

g12654368_3p_at

g5453967_3p_a_at

Participates

as a member of

AMPK beta [cytosol] (Homo sapiens)

Other forms of this molecule

PRKAB1 [nucleoplasm]

Inferred To

prkab1 [cytosol] (Xenopus tropicalis)

aakb-1 [cytosol] (Caenorhabditis elegans)

alc [cytosol] (Drosophila melanogaster)

Prkab1 [cytosol] (Mus musculus)

Prkab1 [cytosol] (Rattus norvegicus)

PRKAB1 [cytosol] (Bos taurus)

PRKAB1 [cytosol] (Canis familiaris)

PRKAB1 [cytosol] (Gallus gallus)

PRKAB1 [cytosol] (Schizosaccharomyces pombe)

PRKAB1 [cytosol] (Sus scrofa)

prkab [cytosol] (Dictyostelium discoideum)

GAL83 [cytosol] (Saccharomyces cerevisiae)

zgc:92228 [cytosol] (Danio rerio)

Cross References

RefSeq

NP_006244.2, XP_005253966.1

Guide to Pharmacology - Targets

1543

OpenTargets

ENSG00000111725

GeneCards

Q9Y478

HPA

ENSG00000111725-PRKAB1

ZINC target

Q9Y478

Ensembl

ENST00000229328, ENSP00000229328, ENSG00000111725, ENST00000541640, ENSP00000441369

PRO

Q9Y478

Pharos - Targets

Q9Y478

PDB

5EZV, 6B1U, 4CFE, 4CFF, 5ISO, 6C9G, 7MYJ, 6C9J, 6C9H, 6C9F, 4ZHX

Interactors (4)

Accession	#Entities	Entities	Confidence Score	Evidence (IntAct)
UniProt:P54646 PRKAA2	4	PRKAA2 [cytosol] (R-HSA-200405) p-T172-PRKAA2 [cytosol] (R-HSA-200417) p-T172-PRKAA2 [nucleoplasm] (R-HSA-164171) PRKAA2 [nucleoplasm] (R-HSA-163682)	0.8	8
UniProt:O75385 ULK1	7	ULK1 [recycling endosome] (R-HSA-8854761) p-S758-ULK1 [cytosol] (R-HSA-5672131) p-S317,467,556,638,T575-ULK1 [cytosol] (R-HSA-5673747) ULK1 [cytosol] (R-HSA-1632847) ULK1 [mitochondrial outer membrane] (R-HSA-8948145) p-T180,S317,S467,S556,S638,T575-ULK1 [endoplasmic reticulum membrane] (R-HSA-8948047) p-T180,S317,S467,S556,S638,T575-ULK1 [cytosol] (R-HSA-5675858)	0.641	3
UniProt:P16152 CBR1	1	CBR1 [cytosol] (R-HSA-2142784)	0.564	2
UniProt:P62993 GRB2	1	GRB2 [cytosol] (R-HSA-8983328)	0.508	2

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